Sau khi hoàn thành phiên bản đầu tiên thì không có kế hoạch cho hậu bản. Tuy nhiên, nhóm đã chia ra thành nhiều nhóm khác để làm các dự án khác. Ban đầu, Kodaka bị thu hút bởi ý tưởng tạo nên tiểu thuyết Danganronpa Zero. Terasawa tiếp cận Kodaka với ý tưởng tạo nên hậu bản vài tháng sau. Kodaka viết kịch bản cho Zero và Goodbye Despair. Nhìn lại, Kodaka cho rằng tiểu thuyết cần nhiều cấu trúc hơn khi so sánh với trò chơi. Anh đã viết những yếu tố nghi ngờ từ phần đầu tiên cũng như nhiều gợi ý cho phần Goodbye Despair. Vì thế Kodaka đề nghị người chơi nên đọc Zero trước khi chơi phần hậu bản[36]. Danganronpa 2: Goodbye Despair, phần hậu bản tiếp nối Danganronpa: Trigger Happy Havoc được công bố vào tháng 4, 2012. Trò chơi được làm bởi Spike Chunsoft (được biết với cái tên Spike trong lúc phát triển) cho hệ máy PSP và được ra mắt tại Nhật vào ngày 26 tháng 7, 2012. Danganronpa 1・2 Reload, phiên bản bao gồm cả 2 phần cho PS Vita được ra mắt cùng lúc với Goodbye Despair tại Nhật vào ngày 10 tháng 10, 2013, và trên toàn thế giới vào ngày 2 tháng 9, 2014[37][38]. Phiên bản thử nghiệm thực tế ảo dựa theo trò chơi có tên Cyber Danganronpa VR: The Class Trial, được ra mắt vào năm 2016[39], trong khi đó phần thứ 3 trong sê-ri, Danganronpa V3: Killing Harmony, được ra mắt vào năm 2017.